rxvt

By default, cygwin uses windows cmd.exe for the terminal. This doesn't allow you to resize, copy and paste is cumbersome, etc… A better option is to install the rxvt package.

Create this file in your Cygwin install location, and use it to start rxvt. Tweak the colors as you wish.

@echo off

C:
chdir C:\cygwin\bin

set EDITOR=vi
set VISUAL=vi
set CYGWIN=codepage:oem tty binmode title

rem rxvt -geometry 120x50 -sr -sl 10000 -fg white -bg black -fn fixedsys -fb fixedsys -tn cygwin -e bash --login -i
rem rxvt -geometry 120x50 -sr -sl 10000 -fg white -bg "SeaGreen" -fn "Lucida Console-11" -fb "Lucida Console-11" -tn cygwin -e bash --login -i
rxvt -geometry 100x40 -sr -sl 10000 -fg white -bg "SpringGreen4" -fn "Lucida Console-11" -fb "Lucida Console-11" -tn cygwin -e bash --login -i

You can further refine your coloring with LS_COLORS in your .profile file:

LS_COLORS='rs=0:di=00;97;44:ln=01;36:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.rar=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=00;36:*.au=00;36:*.flac=00;36:*.mid=00;36:*.midi=00;36:*.mka=00;36:*.mp3=00;36:*.mpc=00;36:*.ogg=00;36:*.ra=00;36:*.wav=00;36:*.axa=00;36:*.oga=00;36:*.spx=00;36:*.xspf=00;36:';
export LS_COLORS